Для аудита фондов и НКО обычно необходимы бухгалтерская и финансовая отчетность, учетная политика, оборотно-сальдовые ведомости, договоры, первичные документы, банковские выписки, документы по грантам, пожертвованиям и субсидиям, сметы, отчеты о целевом использовании средств, налоговые декларации, регистры учета, документы по заработной плате и расчетам с контрагентами. Перечень документов определяется особенностями деятельности организации и целью проверки.